Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTXN3Q4LDR2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms