Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC96Q2M329 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC96Q2M329 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms