Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Q1T7F1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Q1T7F1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Q1T7F1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Q1T7F1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Q1T7F1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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