Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
IMPG1Q17R60 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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