Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 THOC6-208ENST00000574957 1143 ntTSL 1 (best)19.43■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 43.1
EFTUD2Q15029 THOC6-206ENST00000574498 788 ntTSL 316.77■□□□□ 0.283e-7■■■■■ 43.1
EFTUD2Q15029 THOC6-204ENST00000571057 988 ntTSL 1 (best)15.82■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 43.1
EFTUD2Q15029 PER1-208ENST00000579065 1262 ntTSL 516.07■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 43.1
EFTUD2Q15029 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.661e-7■■■■■ 43.1
EFTUD2Q15029 DNAJA3-213ENST00000576911 1413 ntTSL 218.21■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 43.1
EFTUD2Q15029 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 43.1
EFTUD2Q15029 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 43.1
EFTUD2Q15029 DNAJA3-214ENST00000577083 3351 ntTSL 59.34□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 43.1
EFTUD2Q15029 ALDOA-208ENST00000562679 906 ntTSL 513.83□□□□□ -0.22e-13■■■■■ 43.1
EFTUD2Q15029 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.751e-6■■■■■ 43
EFTUD2Q15029 DGAT1-207ENST00000531896 981 ntTSL 324.04■■□□□ 1.441e-6■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 CAPRIN2-212ENST00000541765 630 ntTSL 521.04■□□□□ 0.965e-11■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 TEPSIN-209ENST00000574944 769 ntTSL 317.75■□□□□ 0.439e-7■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 CAPRIN2-205ENST00000454014 4398 ntTSL 1 (best)12.61□□□□□ -0.392e-11■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 CAPRIN2-201ENST00000298892 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-11■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 RAD9A-202ENST00000529100 1037 ntTSL 311.98□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 CAPRIN2-208ENST00000537553 6543 ntTSL 27.47□□□□□ -1.212e-11■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 CAPRIN2-204ENST00000433722 3012 ntTSL 1 (best)7.27□□□□□ -1.242e-11■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 CAPRIN2-216ENST00000548676 3221 ntTSL 1 (best)6.73□□□□□ -1.332e-11■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.372e-11■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 CAPRIN2-207ENST00000537108 2187 ntTSL 56.48□□□□□ -1.375e-11■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.392e-11■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 NEPRO-210ENST00000472166 459 ntTSL 45.74□□□□□ -1.493e-7■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 CAPRIN2-209ENST00000538387 882 ntTSL 34.33□□□□□ -1.725e-11■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 CAPRIN2-214ENST00000543380 628 ntTSL 53.45□□□□□ -1.865e-11■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 CAPRIN2-206ENST00000534897 478 ntTSL 41.94□□□□□ -2.15e-11■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 ATXN2L-218ENST00000565971 3264 ntTSL 1 (best)15.69■□□□□ 0.13e-9■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.184e-13■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 MYBBP1A-206ENST00000572759 588 ntTSL 315.07■□□□□ 03e-7■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 EIF2AK2-202ENST00000390013 564 ntTSL 424.12■■□□□ 1.454e-7■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 CTSD-209ENST00000637158 1200 ntTSL 516.94■□□□□ 0.33e-8■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 AC068580.4-204ENST00000427721 1007 ntTSL 215.27■□□□□ 0.043e-8■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 EIF2AK2-205ENST00000411537 623 ntTSL 513.5□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 EIF2AK2-203ENST00000395127 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.64e-7■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 TRAF4-208ENST00000469529 788 ntTSL 212.71□□□□□ -0.371e-13■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 HMGN2-205ENST00000466194 952 ntTSL 217.06■□□□□ 0.324e-14■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 HERC1-209ENST00000560519 591 ntTSL 38.92□□□□□ -0.988e-39■■■■■ 42.9
EFTUD2Q15029 COL18A1-206ENST00000459895 588 ntTSL 312.56□□□□□ -0.43e-9■■■■■ 42.8
EFTUD2Q15029 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 42.8
EFTUD2Q15029 MBNL3-208ENST00000436215 891 ntTSL 35.08□□□□□ -1.69e-7■■■■■ 42.8
EFTUD2Q15029 PRKCSH-203ENST00000586486 1613 ntTSL 1 (best)16.77■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 42.8
EFTUD2Q15029 UBE2Z-205ENST00000508468 573 ntTSL 319.99■□□□□ 0.793e-24■■■■■ 42.8
EFTUD2Q15029 UBE2Z-206ENST00000511373 769 ntTSL 24.81□□□□□ -1.643e-24■■■■■ 42.8
EFTUD2Q15029 RFXANK-208ENST00000540977 389 ntTSL 211.22□□□□□ -0.617e-8■■■■■ 42.8
EFTUD2Q15029 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 42.8
EFTUD2Q15029 ANKFY1-209ENST00000574367 5033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.911e-7■■■■■ 42.8
EFTUD2Q15029 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 42.8
EFTUD2Q15029 ANKFY1-205ENST00000572412 3352 ntTSL 27.34□□□□□ -1.231e-7■■■■■ 42.8
EFTUD2Q15029 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 42.8
EFTUD2Q15029 RPL3-211ENST00000465618 2108 ntTSL 1 (best)14.74□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 42.8
EFTUD2Q15029 DLG5-203ENST00000459739 3167 ntTSL 1 (best)11.71□□□□□ -0.531e-7■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 DLG5-202ENST00000424842 4292 ntTSL 1 (best)10.2□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.442e-7■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 AURKAIP1-205ENST00000489799 695 ntTSL 1 (best)23.73■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.992e-7■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 AURKAIP1-206ENST00000496905 608 ntTSL 216.87■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 42.7
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EFTUD2Q15029 ANKRD28-202ENST00000412318 4408 ntTSL 24.56□□□□□ -1.688e-10■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 ZKSCAN8-204ENST00000606198 2057 ntTSL 1 (best)9.04□□□□□ -0.962e-9■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 ZKSCAN8-202ENST00000457389 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.062e-9■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.582e-9■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 CLUHP3-202ENST00000411844 582 ntTSL 211.78□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 CIRBP-224ENST00000589686 532 ntTSL 219.94■□□□□ 0.786e-19■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.053e-8■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 GPX4-208ENST00000592940 1184 ntTSL 521.57■■□□□ 1.043e-8■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 GPX4-203ENST00000585480 501 ntTSL 214.09□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 GPX4-204ENST00000587648 536 ntTSL 28.8□□□□□ -13e-8■■■■■ 42.7
EFTUD2Q15029 ACER3-214ENST00000534206 834 ntTSL 526.33■■□□□ 1.814e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ACER3-204ENST00000525861 2058 ntTSL 223.75■■□□□ 1.394e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CAPNS1-214ENST00000592483 431 ntTSL 523.13■■□□□ 1.294e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 CAPNS1-212ENST00000591041 812 ntTSL 322.82■■□□□ 1.244e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ACER3-211ENST00000531461 1292 ntTSL 222.33■■□□□ 1.174e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 ACER3-202ENST00000525194 846 ntTSL 1 (best)22.05■■□□□ 1.124e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.084e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.044e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.94e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.894e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 RFXANK-214ENST00000545522 888 ntTSL 220.01■□□□□ 0.793e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 B4GALNT1-215ENST00000552798 1945 ntTSL 519.98■□□□□ 0.794e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.784e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.774e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.74e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.624e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PPHLN1-222ENST00000552794 579 ntTSL 418.66■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 RFXANK-210ENST00000541873 1002 ntTSL 218.3■□□□□ 0.524e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MED16-209ENST00000592943 1628 ntTSL 1 (best)18.08■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.474e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.414e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.374e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 KDM5C-201ENST00000349663 548 ntTSL 417.1■□□□□ 0.334e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.34e-8■■■■■ 42.6
EFTUD2Q15029 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.294e-8■■■■■ 42.6
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