Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CUL4BQ13620 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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