Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB3Q13509 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TUBB3Q13509 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB3Q13509 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB3Q13509 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB3Q13509 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB3Q13509 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB3Q13509 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TUBB3Q13509 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBB3Q13509 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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