Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.24e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 RRM1-205ENST00000528442 783 ntTSL 37.51□□□□□ -1.214e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 RRM1-202ENST00000526304 514 ntTSL 46.48□□□□□ -1.374e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 RRM1-213ENST00000533495 2381 ntTSL 25.59□□□□□ -1.514e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 RRM1-209ENST00000531591 639 ntTSL 25.18□□□□□ -1.584e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 RRM1-206ENST00000528470 579 ntTSL 35.1□□□□□ -1.594e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 RRM1-207ENST00000529109 448 ntTSL 22.97□□□□□ -1.934e-6■■■□□ 15
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G3BP1Q13283 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.061e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 TCEA3-203ENST00000450454 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.121e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 TCEA3-202ENST00000374602 575 ntTSL 37.93□□□□□ -1.141e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.898e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.018e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 EZR-203ENST00000392177 2933 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.088e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 KARS-211ENST00000569298 589 ntTSL 27.51□□□□□ -1.216e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 PHB2-209ENST00000544134 652 ntTSL 323.49■■□□□ 1.354e-11■■■□□ 15
G3BP1Q13283 FAM98A-204ENST00000464415 655 ntTSL 215.22■□□□□ 0.036e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 FAM98A-208ENST00000498340 489 ntTSL 44.66□□□□□ -1.666e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.363e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.013e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.412e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.42e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.852e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 ABCF1-205ENST00000475993 2860 ntTSL 1 (best)11.96□□□□□ -0.491e-6■■■□□ 15
G3BP1Q13283 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.058e-8■■■□□ 15
G3BP1Q13283 DDB1-220ENST00000542337 558 ntTSL 325.04■■□□□ 1.65e-9■■■□□ 15
G3BP1Q13283 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.786e-8■■■□□ 15
G3BP1Q13283 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.696e-8■■■□□ 15
G3BP1Q13283 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.636e-8■■■□□ 15
G3BP1Q13283 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.636e-8■■■□□ 15
G3BP1Q13283 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.636e-8■■■□□ 15
G3BP1Q13283 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.456e-8■■■□□ 15
G3BP1Q13283 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.446e-8■■■□□ 15
G3BP1Q13283 EIF4G1-222ENST00000442406 5129 ntTSL 1 (best)17.37■□□□□ 0.376e-8■■■□□ 15
G3BP1Q13283 POLR1A-203ENST00000409681 6454 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.48e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.138e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 GOT2-206ENST00000564400 983 ntTSL 314.27□□□□□ -0.132e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 SCRN1-208ENST00000438497 560 ntTSL 410.56□□□□□ -0.722e-10■■■□□ 15
G3BP1Q13283 ST6GAL1-220ENST00000470633 4893 ntTSL 28.64□□□□□ -1.032e-10■■■□□ 15
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G3BP1Q13283 CAPZB-206ENST00000457768 432 ntTSL 315.07■□□□□ 01e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 TRAP1-204ENST00000570514 412 ntTSL 212.07□□□□□ -0.489e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 GPS1-225ENST00000585084 997 ntTSL 335.23■■■■□ 3.231e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 GPS1-212ENST00000580716 567 ntTSL 421.55■■□□□ 1.041e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 GPS1-213ENST00000580723 594 ntTSL 420.46■□□□□ 0.871e-7■■■□□ 15
G3BP1Q13283 GPS1-219ENST00000583641 795 ntTSL 218.96■□□□□ 0.631e-7■■■□□ 15
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G3BP1Q13283 ABHD14A-ACY1-211ENST00000636085 1188 ntTSL 517.6■□□□□ 0.414e-7■■■□□ 15
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G3BP1Q13283 ANXA7-201ENST00000372919 2174 ntTSL 1 (best)15.53■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 ANXA7-202ENST00000372921 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 14.9
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G3BP1Q13283 LMO7-203ENST00000357063 8237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.971e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.991e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 ACY1-221ENST00000637199 790 ntTSL 220.03■□□□□ 0.86e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PKM-212ENST00000564440 3016 ntTSL 1 (best)11.14□□□□□ -0.632e-10■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.231e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 CSNK2A1-210ENST00000619801 655 ntTSL 310.93□□□□□ -0.662e-6■■■□□ 14.9
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G3BP1Q13283 QARS-238ENST00000635231 578 ntTSL 412.84□□□□□ -0.354e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.612e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.381e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.141e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 SDHA-210ENST00000509420 580 ntTSL 216.46■□□□□ 0.233e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 NPEPPS-201ENST00000322157 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.386e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 ATIC-203ENST00000426233 713 ntTSL 25.96□□□□□ -1.463e-9■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 KRT8-204ENST00000546826 1165 ntTSL 521.48■■□□□ 1.033e-9■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PCK2-214ENST00000560736 897 ntTSL 327.93■■■□□ 2.062e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PCK2-211ENST00000559837 756 ntTSL 321.01■□□□□ 0.952e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 HNRNPA2B1-206ENST00000490912 5328 ntTSL 218.31■□□□□ 0.522e-9■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 HNRNPA2B1-203ENST00000360787 1724 ntTSL 518.13■□□□□ 0.492e-9■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 216.94■□□□□ 0.32e-9■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.072e-9■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.292e-9■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.842e-9■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 HNRNPM-203ENST00000593293 764 ntTSL 33.52□□□□□ -1.854e-12■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 ARL6IP1-207ENST00000567969 581 ntTSL 223.31■■□□□ 1.328e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 ARL6IP1-206ENST00000566391 806 ntTSL 223.25■■□□□ 1.318e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 ARL6IP1-203ENST00000562234 391 ntTSL 520.86■□□□□ 0.938e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.758e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.678e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 ARL6IP1-208ENST00000569976 778 ntTSL 218.19■□□□□ 0.58e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 ARL6IP1-204ENST00000562819 578 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.928e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.058e-8■■■□□ 14.9
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