Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
GRIN2BQ13224 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
GRIN2BQ13224 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
GRIN2BQ13224 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
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