Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFT88Q13099 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFT88Q13099 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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