Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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