Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 YBR139WYBR139W 1527 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 ATG17YLR423C 1254 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 MRPS9YBR146W 837 nt3.42□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 TEL1YBL088C 8364 nt3.41□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 POL12YBL035C 2118 nt3.4□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 YBR209WYBR209W 318 nt3.4□□□□□ -1.86
TY1B-BRQ12193 PEX8YGR077C 1770 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 YNL013CYNL013C 378 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 HSH155YMR288W 2916 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 PDC2YDR081C 2778 nt3.4□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 GIP1YBR045C 1920 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 YCR064CYCR064C 411 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 COX2Q0250 756 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 REX4YOL080C 870 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 YHR177WYHR177W 1362 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 SRP68YPL243W 1800 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 RRP12YPL012W 3687 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 FRE4YNR060W 2160 nt3.39□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 DCP2YNL118C 2913 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 MCD4YKL165C 2760 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 VPS72YDR485C 2388 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 RPC17YJL011C 486 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 MET14YKL001C 609 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 PBA1YLR199C 831 nt3.38□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 SSK2YNR031C 4740 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 BAR1YIL015W 1764 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 BCH2YKR027W 2298 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 APP1YNL094W 1764 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 YIL025CYIL025C 375 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 PEX6YNL329C 3093 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 RAD7YJR052W 1698 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 OPT2YPR194C 2634 nt3.37□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 TAF12YDR145W 1620 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 ENT1YDL161W 1365 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 GAB1YLR459W 1185 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 SFB2YNL049C 2631 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 CIN1YOR349W 3045 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 SRB8YCR081W 4284 nt3.36□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 SPO14YKR031C 5052 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 KRE33YNL132W 3171 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 DUG2YBR281C 2637 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 SSF2YDR312W 1362 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 SIR4YDR227W 4077 nt3.35□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 PCL8YPL219W 1479 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 VFA1YER128W 612 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 AIM22YJL046W 1230 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 TAF4YMR005W 1167 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 SMA1YPL027W 738 nt3.34□□□□□ -1.87
TY1B-BRQ12193 PIP2YOR363C 2991 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 PRP11YDL043C 801 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 USE1YGL098W 738 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt3.33□□□□□ -1.88
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TY1B-BRQ12193 SSN2YDR443C 4263 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 SVL3YPL032C 2478 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 NEO1YIL048W 3456 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 TAF3YPL011C 1062 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 YIL092WYIL092W 1902 nt3.33□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 RRP5YMR229C 5190 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 SKM1YOL113W 1968 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 SPO73YER046W 432 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 YLR302CYLR302C 363 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 SWC7YLR385C 399 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 MSH4YFL003C 2637 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 CTF4YPR135W 2784 nt3.32□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 FAR1YJL157C 2493 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 STE14YDR410C 720 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 YER133W-AYER133W-A 342 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 ECO1YFR027W 846 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 ERG25YGR060W 930 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 PPT2YPL148C 522 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 SCD6YPR129W 1050 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 PUF6YDR496C 1971 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 SLM2YNL047C 1971 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 snR83snR83 306 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 NVJ1YHR195W 966 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 PML39YML107C 1005 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 MSS18YPR134W 807 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 BNR1YIL159W 4128 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 VAC14YLR386W 2643 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 TFC3YAL001C 3483 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 ROM1YGR070W 3468 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 MNR2YKL064W 2910 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 YDR535CYDR535C 501 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 SSO2YMR183C 888 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 RTT107YHR154W 3213 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 SPF1YEL031W 3648 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 PST1YDR055W 1335 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 RAS1YOR101W 930 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 SAT4YCR008W 1812 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1B-BRQ12193 TRI1YMR233W 681 nt3.28□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 snR17asnR17a 333 nt3.28□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 POL30YBR088C 777 nt3.28□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 SEG1YMR086W 2883 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 SIP3YNL257C 3690 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 PEP7YDR323C 1548 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 CDH1YGL003C 1701 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 TAE2YPL009C 3117 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1B-BRQ12193 DOA4YDR069C 2781 nt3.26□□□□□ -1.89
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