Protein–RNA interactions for Protein: Q12088

TY1B-LR1, Transposon Ty1-LR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-LR1Q12088 SRT1YMR101C 1032 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 ENT1YDL161W 1365 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 SPO14YKR031C 5052 nt3.31□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 RPC17YJL011C 486 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 FAR1YJL157C 2493 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 CST9YLR394W 1449 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 PPT2YPL148C 522 nt3.3□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 CIN1YOR349W 3045 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 YJR098CYJR098C 1971 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 VFA1YER128W 612 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 ECO1YFR027W 846 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 SVL3YPL032C 2478 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 VPS13YLL040C 9435 nt3.29□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 ATG1YGL180W 2694 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 GAB1YLR459W 1185 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 NOP13YNL175C 1212 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 IRC8YJL051W 2469 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 PEX8YGR077C 1770 nt3.28□□□□□ -1.88
TY1B-LR1Q12088 SSD1YDR293C 3753 nt3.28□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 RRP5YMR229C 5190 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 MNR2YKL064W 2910 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 DIS3YOL021C 3006 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 DUG2YBR281C 2637 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 SPO73YER046W 432 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 YKR073CYKR073C 321 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 ORM2YLR350W 651 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 SCD6YPR129W 1050 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 YKR023WYKR023W 1593 nt3.27□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 NUP159YIL115C 4383 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 ERG25YGR060W 930 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 GEP4YHR100C 558 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 MET14YKL001C 609 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 NEO1YIL048W 3456 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 CDH1YGL003C 1701 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 ROM1YGR070W 3468 nt3.26□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 BET1YIL004C 429 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 TRI1YMR233W 681 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 TMC1YOR052C 453 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 NUP100YKL068W 2880 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 ESL1YIL151C 3357 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 TFC3YAL001C 3483 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 ATG17YLR423C 1254 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 SLM2YNL047C 1971 nt3.25□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 VAC14YLR386W 2643 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 SIP3YNL257C 3690 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 SSK2YNR031C 4740 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 MPP10YJR002W 1782 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 YER079C-AYER079C-A 339 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 TAF4YMR005W 1167 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 SAS5YOR213C 747 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 MSS18YPR134W 807 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 HPR1YDR138W 2259 nt3.24□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 DOA4YDR069C 2781 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 BNR1YIL159W 4128 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 SYS1YJL004C 612 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 RAS1YOR101W 930 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 SRP68YPL243W 1800 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 YIL092WYIL092W 1902 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 HSH155YMR288W 2916 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 YOL098CYOL098C 3114 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 RPS23AYGR118W 438 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 RPS23BYPR132W 438 nt3.23□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 REV3YPL167C 4515 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 YDR535CYDR535C 501 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 RPL27AYHR010W 411 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 YLR122CYLR122C 378 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 SEG1YMR086W 2883 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 SFB2YNL049C 2631 nt3.22□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 ATG7YHR171W 1893 nt3.21□□□□□ -1.89
TY1B-LR1Q12088 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 SIR4YDR227W 4077 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 PUF6YDR496C 1971 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 KRE33YNL132W 3171 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 TAE2YPL009C 3117 nt3.21□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 FLO1YAR050W 4614 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 YLR125WYLR125W 411 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 DCP2YNL118C 2913 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 SSN2YDR443C 4263 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 YBL065WYBL065W 345 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 snR17asnR17a 333 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt3.2□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 SSF2YDR312W 1362 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 REB1YBR049C 2433 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 RPO21YDL140C 5202 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 YMR046CYMR046C 1323 nt3.19□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 UNG1YML021C 1080 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 POL30YBR088C 777 nt3.18□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 BUD4YJR092W 4344 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 SPF1YEL031W 3648 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 YSP2YDR326C 4317 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 RPL17BYJL177W 555 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 PST1YDR055W 1335 nt3.17□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 TAF12YDR145W 1620 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 YLR302CYLR302C 363 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 SSO2YMR183C 888 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1B-LR1Q12088 WHI4YDL224C 1950 nt3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 142.2 ms