Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
EMX2Q04743 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
EMX2Q04743 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMX2Q04743 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms