Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IRF9Q00978 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IRF9Q00978 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms