Protein–RNA interactions for Protein: P98187

CYP4F8, Cytochrome P450 4F8, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F8P98187 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYP4F8P98187 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CYP4F8P98187 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms