Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CASP7P55210 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP7P55210 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP7P55210 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP7P55210 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP7P55210 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP7P55210 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP7P55210 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP7P55210 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP7P55210 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP7P55210 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP7P55210 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP7P55210 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CASP7P55210 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP7P55210 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CASP7P55210 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP7P55210 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP7P55210 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP7P55210 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP7P55210 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP7P55210 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP7P55210 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP7P55210 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP7P55210 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP7P55210 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CASP7P55210 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASP7P55210 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASP7P55210 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASP7P55210 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CASP7P55210 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP7P55210 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP7P55210 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP7P55210 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP7P55210 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP7P55210 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP7P55210 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP7P55210 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP7P55210 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP7P55210 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CASP7P55210 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CASP7P55210 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP7P55210 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP7P55210 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP7P55210 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP7P55210 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP7P55210 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP7P55210 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP7P55210 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP7P55210 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP7P55210 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP7P55210 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP7P55210 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP7P55210 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CASP7P55210 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP7P55210 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP7P55210 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP7P55210 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP7P55210 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP7P55210 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP7P55210 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP7P55210 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP7P55210 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP7P55210 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP7P55210 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CASP7P55210 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP7P55210 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP7P55210 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP7P55210 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP7P55210 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP7P55210 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP7P55210 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP7P55210 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP7P55210 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP7P55210 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP7P55210 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP7P55210 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP7P55210 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CASP7P55210 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CASP7P55210 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms