Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTDSS1P48651 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTDSS1P48651 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms