Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GCLCP48506 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GCLCP48506 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLCP48506 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLCP48506 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLCP48506 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLCP48506 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLCP48506 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLCP48506 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLCP48506 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLCP48506 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLCP48506 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GCLCP48506 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLCP48506 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLCP48506 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLCP48506 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GCLCP48506 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GCLCP48506 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GCLCP48506 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLCP48506 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLCP48506 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLCP48506 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLCP48506 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLCP48506 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLCP48506 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GCLCP48506 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLCP48506 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLCP48506 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLCP48506 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLCP48506 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLCP48506 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLCP48506 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLCP48506 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLCP48506 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLCP48506 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLCP48506 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLCP48506 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLCP48506 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GCLCP48506 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLCP48506 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLCP48506 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLCP48506 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLCP48506 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLCP48506 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLCP48506 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLCP48506 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GCLCP48506 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLCP48506 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLCP48506 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLCP48506 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLCP48506 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GCLCP48506 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms