Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFMP43652 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AFMP43652 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFMP43652 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFMP43652 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFMP43652 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFMP43652 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFMP43652 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFMP43652 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFMP43652 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFMP43652 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AFMP43652 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AFMP43652 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AFMP43652 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
AFMP43652 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AFMP43652 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFMP43652 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFMP43652 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFMP43652 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFMP43652 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFMP43652 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFMP43652 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFMP43652 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
AFMP43652 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AFMP43652 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AFMP43652 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AFMP43652 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFMP43652 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFMP43652 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFMP43652 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFMP43652 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFMP43652 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFMP43652 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFMP43652 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFMP43652 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFMP43652 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFMP43652 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFMP43652 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFMP43652 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AFMP43652 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
AFMP43652 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms