Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL35P42766 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL35P42766 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL35P42766 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPL35P42766 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPL35P42766 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RPL35P42766 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RPL35P42766 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPL35P42766 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPL35P42766 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPL35P42766 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RPL35P42766 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RPL35P42766 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RPL35P42766 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms