Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CEACAM3P40198 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEACAM3P40198 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms