Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2H1P32780 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2H1P32780 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms