Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HLA-DMAP28067 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HLA-DMAP28067 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms