Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ATP5F1P24539 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATP5F1P24539 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms