Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HRCP23327 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HRCP23327 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HRCP23327 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HRCP23327 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HRCP23327 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HRCP23327 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HRCP23327 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HRCP23327 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HRCP23327 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HRCP23327 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HRCP23327 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HRCP23327 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HRCP23327 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
HRCP23327 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
HRCP23327 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HRCP23327 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
HRCP23327 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HRCP23327 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
HRCP23327 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HRCP23327 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
HRCP23327 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
HRCP23327 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
HRCP23327 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
HRCP23327 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
HRCP23327 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
HRCP23327 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HRCP23327 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HRCP23327 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HRCP23327 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
HRCP23327 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
HRCP23327 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
HRCP23327 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HRCP23327 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HRCP23327 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
HRCP23327 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
HRCP23327 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HRCP23327 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HRCP23327 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HRCP23327 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
HRCP23327 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HRCP23327 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HRCP23327 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HRCP23327 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HRCP23327 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HRCP23327 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HRCP23327 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HRCP23327 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HRCP23327 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
HRCP23327 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
HRCP23327 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HRCP23327 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
HRCP23327 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HRCP23327 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HRCP23327 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HRCP23327 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HRCP23327 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HRCP23327 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HRCP23327 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HRCP23327 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HRCP23327 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HRCP23327 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HRCP23327 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HRCP23327 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HRCP23327 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HRCP23327 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HRCP23327 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HRCP23327 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
HRCP23327 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HRCP23327 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
HRCP23327 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
HRCP23327 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
HRCP23327 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
HRCP23327 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HRCP23327 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HRCP23327 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
HRCP23327 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
HRCP23327 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HRCP23327 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HRCP23327 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HRCP23327 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HRCP23327 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HRCP23327 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HRCP23327 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HRCP23327 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HRCP23327 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HRCP23327 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HRCP23327 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HRCP23327 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HRCP23327 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HRCP23327 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HRCP23327 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HRCP23327 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HRCP23327 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HRCP23327 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HRCP23327 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HRCP23327 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HRCP23327 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
HRCP23327 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
HRCP23327 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms