Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOXA5P20719 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms