Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB4AP20338 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms