Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATF4P18848 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATF4P18848 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATF4P18848 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATF4P18848 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATF4P18848 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATF4P18848 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATF4P18848 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATF4P18848 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATF4P18848 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATF4P18848 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATF4P18848 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATF4P18848 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATF4P18848 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATF4P18848 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATF4P18848 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF4P18848 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF4P18848 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF4P18848 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF4P18848 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF4P18848 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF4P18848 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF4P18848 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF4P18848 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF4P18848 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF4P18848 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF4P18848 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF4P18848 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATF4P18848 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATF4P18848 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms