Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL1P09341 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms