Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNB1P01574 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFNB1P01574 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms