Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
STAMBPO95630 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
STAMBPO95630 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms