Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBNO60934 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBNO60934 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBNO60934 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBNO60934 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBNO60934 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBNO60934 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NBNO60934 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBNO60934 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NBNO60934 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBNO60934 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBNO60934 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBNO60934 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NBNO60934 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBNO60934 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBNO60934 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NBNO60934 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBNO60934 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBNO60934 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBNO60934 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NBNO60934 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBNO60934 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBNO60934 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBNO60934 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBNO60934 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBNO60934 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBNO60934 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NBNO60934 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBNO60934 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBNO60934 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NBNO60934 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NBNO60934 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBNO60934 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBNO60934 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBNO60934 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBNO60934 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBNO60934 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBNO60934 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NBNO60934 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBNO60934 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NBNO60934 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBNO60934 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBNO60934 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBNO60934 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBNO60934 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NBNO60934 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NBNO60934 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBNO60934 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBNO60934 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBNO60934 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NBNO60934 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms