Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXD2O60548 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXD2O60548 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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