Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRAK2O60296 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRAK2O60296 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms