Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPHB6O15197 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms