Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BHLHE40O14503 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BHLHE40O14503 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms