Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
E9PCH4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
E9PCH4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
E9PCH4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
E9PCH4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
E9PCH4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
E9PCH4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
E9PCH4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
E9PCH4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
E9PCH4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
E9PCH4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
E9PCH4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
E9PCH4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
E9PCH4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
E9PCH4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
E9PCH4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
E9PCH4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
E9PCH4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
E9PCH4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
E9PCH4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
E9PCH4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
E9PCH4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
E9PCH4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
E9PCH4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
E9PCH4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
E9PCH4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
E9PCH4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
E9PCH4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
E9PCH4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
E9PCH4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
E9PCH4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
E9PCH4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
E9PCH4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
E9PCH4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
E9PCH4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
E9PCH4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
E9PCH4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
E9PCH4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
E9PCH4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
E9PCH4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
E9PCH4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
E9PCH4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
E9PCH4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
E9PCH4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
E9PCH4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
E9PCH4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
E9PCH4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
E9PCH4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
E9PCH4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
E9PCH4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
E9PCH4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
E9PCH4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
E9PCH4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
E9PCH4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
E9PCH4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
E9PCH4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
E9PCH4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
E9PCH4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
E9PCH4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
E9PCH4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
E9PCH4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
E9PCH4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
E9PCH4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
E9PCH4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
E9PCH4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
E9PCH4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
E9PCH4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
E9PCH4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
E9PCH4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
E9PCH4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
E9PCH4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
E9PCH4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
E9PCH4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
E9PCH4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
E9PCH4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
E9PCH4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
E9PCH4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
E9PCH4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
E9PCH4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
E9PCH4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
E9PCH4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
E9PCH4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
E9PCH4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
E9PCH4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
E9PCH4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
E9PCH4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
E9PCH4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms