Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
A6NDN8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
A6NDN8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
A6NDN8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A6NDN8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A6NDN8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A6NDN8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A6NDN8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A6NDN8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A6NDN8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A6NDN8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A6NDN8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A6NDN8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A6NDN8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms