Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GMNCA6NCL1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMNCA6NCL1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms