Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
A0A0U1RQF3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
A0A0U1RQF3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms