Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 CD79A-202ENST00000444740 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 RPSAP16-201ENST00000447583 821 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 AP003692.1-202ENST00000510185 502 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC022239.3-201ENST00000528629 544 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC016182.1-201ENST00000587621 582 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 PLXNA4-204ENST00000423507 3314 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 FCGR1A-201ENST00000369168 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 GHRL-202ENST00000335542 1425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 SP3P-201ENST00000414049 2065 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC104667.1-201ENST00000417947 2057 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC114760.2-201ENST00000606818 2065 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 BEST1-201ENST00000378043 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 ARHGEF39-201ENST00000378387 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 CPEB1-216ENST00000618449 2459 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 KIF2C-202ENST00000372224 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 AMBRA1-202ENST00000458649 5351 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 RAE1-201ENST00000371242 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 EFCAB8-201ENST00000400522 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 MSH5-SAPCD1-207ENST00000493662 3991 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC099494.3-201ENST00000623645 1722 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 ZDHHC15-203ENST00000541184 6012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 LINC01568-206ENST00000562748 1480 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
RORCP51449 GFI1B-201ENST00000339463 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 SLC24A4-205ENST00000532405 9950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC068448.1-201ENST00000623902 3925 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 CLCN6-202ENST00000346436 5583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 PLAC4-201ENST00000623119 5588 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 OGFOD1-207ENST00000566157 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 PDLIM5-210ENST00000508216 1794 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 NSL1-202ENST00000366977 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC106872.9-201ENST00000512437 1393 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 ECD-205ENST00000454759 2084 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 ARHGEF9-233ENST00000637520 5682 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 SLC25A21-201ENST00000331299 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 KLHL15-201ENST00000328046 6272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 NIF3L1-204ENST00000409357 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 RTN3-208ENST00000537981 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 FRMPD1-203ENST00000539465 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 TCAIM-202ENST00000383746 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 SLC4A1AP-201ENST00000326019 2959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC007992.2-201ENST00000604771 835 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 AL109618.3-201ENST00000622748 430 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 AC073488.4-201ENST00000632688 757 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 TRIM26-266ENST00000437089 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 PLA2G4D-201ENST00000290472 3584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 TPCN1-202ENST00000392569 2558 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 EML1-202ENST00000327921 3715 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 BARD1-210ENST00000613374 4096 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 REXO5-202ENST00000348433 2604 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 SPECC1-204ENST00000395527 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 PDSS2-202ENST00000369037 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 AMD1P4-201ENST00000299540 1345 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 KIAA0319-202ENST00000430948 6620 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 ZMAT3-201ENST00000311417 9406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 AP000866.2-201ENST00000504932 1493 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 TREML4-201ENST00000341495 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 POLR1E-201ENST00000377792 2229 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 CAPN3-205ENST00000357568 2669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 API5-201ENST00000378852 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 NUP58-202ENST00000381736 4332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RORCP51449 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RORCP51449 ESR1-202ENST00000338799 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RORCP51449 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RORCP51449 CLN8-201ENST00000331222 7169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RORCP51449 SFXN5-201ENST00000272433 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RORCP51449 OPHN1-201ENST00000355520 7879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.9 ms