Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms