Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUBP2Q9Y5Y2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUBP2Q9Y5Y2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms