Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI1Q9ULC6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI1Q9ULC6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI1Q9ULC6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI1Q9ULC6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI1Q9ULC6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI1Q9ULC6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI1Q9ULC6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI1Q9ULC6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI1Q9ULC6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI1Q9ULC6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI1Q9ULC6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI1Q9ULC6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PADI1Q9ULC6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PADI1Q9ULC6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PADI1Q9ULC6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms