Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FANCLQ9NW38 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCLQ9NW38 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms