Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATAD3AQ9NVI7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATAD3AQ9NVI7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms