Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 AC073575.1-201ENST00000551125 596 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FOXD4L1Q9NU39 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXD4L1Q9NU39 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms