Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-202ENST00000316853 1287 ntTSL 1 (best)19.42■□□□□ 0.77e-7■■■■■ 283.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-217ENST00000566661 2232 ntTSL 518.61■□□□□ 0.577e-7■■■■■ 283.1
UTP3Q9NQZ2 KLHDC4-208ENST00000562261 1065 ntTSL 316.09■□□□□ 0.177e-7■■■■■ 283.1
UTP3Q9NQZ2 MTF2-207ENST00000474314 816 ntTSL 516.02■□□□□ 0.163e-15■■■■■ 282.6
UTP3Q9NQZ2 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.033e-15■■■■■ 282.6
UTP3Q9NQZ2 MTF2-211ENST00000494963 885 ntTSL 511.41□□□□□ -0.583e-15■■■■■ 282.6
UTP3Q9NQZ2 MTF2-213ENST00000540243 3845 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.753e-15■■■■■ 282.6
UTP3Q9NQZ2 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.813e-15■■■■■ 282.6
UTP3Q9NQZ2 MTF2-201ENST00000370298 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.863e-15■■■■■ 282.6
UTP3Q9NQZ2 MTF2-205ENST00000471953 1937 ntTSL 27.7□□□□□ -1.183e-15■■■■■ 282.6
UTP3Q9NQZ2 MTF2-206ENST00000473430 760 ntTSL 55.49□□□□□ -1.533e-15■■■■■ 282.6
UTP3Q9NQZ2 ATP13A1-207ENST00000473243 4729 ntTSL 216.45■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 282.2
UTP3Q9NQZ2 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 282.2
UTP3Q9NQZ2 ATP13A1-214ENST00000497556 2442 ntTSL 214.64□□□□□ -0.073e-6■■■■■ 282.2
UTP3Q9NQZ2 ATP13A1-201ENST00000291503 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 282.2
UTP3Q9NQZ2 ATP13A1-205ENST00000469641 4241 ntTSL 211.65□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 282.2
UTP3Q9NQZ2 OSBPL5-206ENST00000471998 2182 ntTSL 221.05■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 282
UTP3Q9NQZ2 OSBPL5-219ENST00000534491 2224 ntTSL 1 (best)17.76■□□□□ 0.431e-6■■■■■ 282
UTP3Q9NQZ2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 282
UTP3Q9NQZ2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 282
UTP3Q9NQZ2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 282
UTP3Q9NQZ2 MINK1-211ENST00000575511 621 ntTSL 216.71■□□□□ 0.272e-26■■■■■ 282
UTP3Q9NQZ2 ATG16L2-208ENST00000537143 519 ntTSL 224.22■■□□□ 1.472e-10■■■■■ 281.9
UTP3Q9NQZ2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 281.8
UTP3Q9NQZ2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.612e-7■■■■■ 281.6
UTP3Q9NQZ2 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 281.6
UTP3Q9NQZ2 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 281.6
UTP3Q9NQZ2 VDAC2-201ENST00000298468 931 ntTSL 56.71□□□□□ -1.342e-7■■■■■ 281.6
UTP3Q9NQZ2 RHBDF1-210ENST00000487201 1708 ntTSL 524.08■■□□□ 1.456e-12■■■■■ 281.3
UTP3Q9NQZ2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.375e-8■■■■■ 281.3
UTP3Q9NQZ2 RHBDF1-206ENST00000450643 615 ntTSL 418.35■□□□□ 0.536e-12■■■■■ 281.3
UTP3Q9NQZ2 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.297e-7■■■■■ 280.7
UTP3Q9NQZ2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.188e-7■■■■■ 280.4
UTP3Q9NQZ2 SVIL-AS1-201ENST00000413405 767 ntTSL 1 (best)14.4□□□□□ -0.18e-7■■■■■ 280.4
UTP3Q9NQZ2 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.88e-7■■■■■ 280.4
UTP3Q9NQZ2 SVIL-AS1-207ENST00000445521 188 ntTSL 49.77□□□□□ -0.858e-7■■■■■ 280.4
UTP3Q9NQZ2 SVIL-AS1-203ENST00000423223 507 ntTSL 26.04□□□□□ -1.448e-7■■■■■ 280.4
UTP3Q9NQZ2 SVIL-AS1-209ENST00000455774 478 ntTSL 35.65□□□□□ -1.58e-7■■■■■ 280.4
UTP3Q9NQZ2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.214e-7■■■■■ 279.9
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-230ENST00000507877 578 ntTSL 47.78□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 279.8
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-213ENST00000434420 386 ntTSL 44.41□□□□□ -1.71e-6■■■■■ 279.8
UTP3Q9NQZ2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.965e-8■■■■■ 279.8
UTP3Q9NQZ2 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 424.24■■□□□ 1.478e-7■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.238e-7■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-214ENST00000639665 2090 ntTSL 526.45■■□□□ 1.822e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-211ENST00000639398 2127 ntTSL 525.99■■□□□ 1.752e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.69■■□□□ 1.72e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.482e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.322e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.322e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-209ENST00000639115 2524 ntTSL 522.73■■□□□ 1.232e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.222e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-217ENST00000640530 2426 ntTSL 522.53■■□□□ 1.22e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.152e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.12e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.072e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.062e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.964e-8■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 FOXN3-211ENST00000555855 851 ntTSL 520.54■□□□□ 0.885e-15■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 EPHB4-205ENST00000478459 965 ntTSL 220.46■□□□□ 0.872e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.791e-13■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-219ENST00000640967 2569 ntTSL 519.78■□□□□ 0.762e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.672e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.22■□□□□ 0.672e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.652e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 COX10-204ENST00000581931 1509 ntTSL 218.84■□□□□ 0.614e-8■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.542e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 MTG1-208ENST00000498790 693 ntTSL 217.94■□□□□ 0.462e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 COX10-203ENST00000580561 1384 ntTSL 217.4■□□□□ 0.384e-8■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 WDR47-207ENST00000529074 586 ntTSL 417.31■□□□□ 0.363e-14■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 NSD2-215ENST00000507094 563 ntTSL 416.73■□□□□ 0.272e-26■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 ICAM1-204ENST00000588645 581 ntTSL 216.63■□□□□ 0.251e-13■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.242e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.244e-8■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 KLF6-203ENST00000461124 764 ntTSL 516.32■□□□□ 0.22e-26■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-217ENST00000533188 581 ntTSL 315.6■□□□□ 0.092e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-205ENST00000481851 741 ntTSL 215.55■□□□□ 0.082e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.062e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.044e-8■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-212ENST00000529975 548 ntTSL 415.17■□□□□ 0.022e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.044e-8■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-206ENST00000524951 582 ntTSL 214.81□□□□□ -0.042e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 C5orf56-204ENST00000407797 1570 ntTSL 514.56□□□□□ -0.084e-8■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.133e-14■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.143e-14■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 WDR47-203ENST00000369962 4199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.163e-14■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.171e-10■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 USP3-203ENST00000538686 2077 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.172e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 CSRP1-210ENST00000527573 567 ntTSL 213.87□□□□□ -0.192e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 MAGEB1-202ENST00000397548 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.192e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 WDR47-209ENST00000531337 469 ntTSL 413.72□□□□□ -0.213e-14■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 BRPF1-208ENST00000497565 689 ntTSL 313.72□□□□□ -0.212e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 USP3-213ENST00000559711 1693 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.222e-22■■■■■ 279.5
UTP3Q9NQZ2 WDR47-206ENST00000528747 580 ntTSL 413.52□□□□□ -0.253e-14■■■■■ 279.5
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