Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNMDQ9H2S6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNMDQ9H2S6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms